En el caso de poner CFW 3.55 KMEAW (los otros no los he probado):
Si los juegos no pedían OFW 3.5 o 3.55 deberían funcionar sin problemas ( he dicho deberían ...), en cambio si pedian ofw 3.5 o 3.55 , has tenido que modificar el eboot y algun otro fichero para que se puedan correr en 3.41, estos juegos deberás dejarlos tal y cuales fueron ripeados, es decir deberas volver a los eboots y ficheros de origen.
En el caso de pasar a CFW 3.41 de Hermes:
En este caso, no creo que debas modificiar nada, ya que el CFW de Hermes se comporta de la misma manera que el jailbreak por USB, es decir que tus juegos deberían funcionar igual que ahora.
Un saludo