creo q jarek no ha entendido la pregunta, la verdad esq no he tenido esa experiencia por lo q no te puedo decir seguro, pero creo q si lo formateas a 48 bits y tu hdloader no lo reconoce, por ejemplo el HDadvance 2.0 , pues no podrias arrancar la imagen ya q no lo reconoceria...
Creo recordar q alguien comento q al arrancar con el hdadvance 2.0 con un disco formateado a 48bits le decia q el disco tenia q ser formateado y mostraba la opcion, con la consiguiente perdida de datos.