poder se puede hacer pero te puede dar problemas.
lo que te recomiendo es que dejes el home en una partición
de linux pero los datos grandes los guardes en la partición
fat.
Si usas enlaces simbolicos veras esos directorios como si estuvieran
en tu directorio home
Ej:
creas un directorio /mnt/D/descargas
y lo enlacas a /home/tu/descargas
(para crear dicho enlace o usas el konkero u otro navegador
de archivos con la opción enlazar
o por linea de comandos con ln)
.
