Si no borraste la cuenta desde la eShop, sigue ahí. Tú o quien use la consola puede volver a descargar los juegos que hayas comprado previamente, aunque hayas formateado la consola.
Por otro lado, la cuenta de la eShop es una cosa, y la del Club Nintendo es otra. Aunque estén vinculadas son dos cuentas distintas. Desde la eShop puedes borrar la cuenta de la eShop pero no la del Club.
