Basicamente eres un cientifico llamado Gordon Freeman,trabajas en lso laboratorios secretos de Black mesa,que estaban investigando como abrir puertas dimensionales,uno de los experimentos fallo y toda la zona de laboratorios se infesto de seres de otra dimension,los marines llegaron a la zona para exterminarlos pero el problema es que tenian que exterminar cualquier prueba de que esto habia sucedido...incluido a los cientiificos.
Fuiste de los pocos que sobrevivieron y es mas,viajaste al mundo de los alienigenas,destruyendo lo que parecia ser uno de sus lideres,al volver un hombre misterioso que veias alguna que otra vez durante el juego te da a elegir entre unirte a el o no unirte(con lo que te dejaba en una zona llena de alienigenas y sin armas).
Enga un saludo.