un archivo MKV es un contendor de pistas de video y audio.....
debes elegir el idioma que quieres que te seleccione, ya que lo mkv pueden contener varias pistas de idioma....y un vob solo una.....el transcode ponlo en automatico.....y solo debes dividir en dos si lo vas a ver en la ps3 con un disco extraible,,,ya que como la ps3 solo reconoce disco en fat32 no puedes pasar de 4g....
si lo vas a ver por servidor multimedia no importa el tamaño.....puedes usar el tversity.....eso si debes usar cable de red,,,ya que el wifi no tiene suficiente ancho de banda para pelis en 1080..