En la opción integrated peripherals tienes que tener activado "onboard H/W raid".
Cuando tienes activada esa opción, que activa el chip gigaraid, o lo que es lo mismo, la controladora de esos dos conectores ide extras, y una vez pasado el primer test de Devices, (donde detecta discos duros etc) te aparecera como un segundo testeo, donde te pondrá una tecla para configurarlo ( no recuerdo cual).
Luego, necesitaras los drivers para que te los detecte windows ( si tenias la opcion esa en la bios desactivada, tendrás un dispositivo desconocido en el administrador de dispositivosç
Pd: Hay que leerse los manuales, que es donde pone esas cositas....