Cualquier tipo de tema se escribe en la flash, la unica diferencia esque los que van en MS:/PSP/THEME/ usualmente se crean con la herramienta Theme Creator oficial de Sony, por lo que son seguros. Sin embargo, los temas creados para ser colocados en la flash directamente, es decir, ingresando por USB, y luego borrando y sustituyendo datos manualmente... bueno, yo no les confio mucho, me da miedo hacerlo. Aunque dicen que si tienes un backup de la flash0 lo puedes arreglar.
Yo me quedo con los temas creados con el theme creator.