Bueno, depende de qué clase de scene vayas a utilizar, siempre y cuando las dos consolas estén 100% arregladas y operativas.
Si vas a usar backups, usa la consola de 80 para estas, los emus, ftp y demás homebrew no ocupan tanto. Y para el online supongo que sólo jugarás a los pocos títulos que saquen verdadero jugo al online, por lo que la de 40 irá bien.
Si te falta disco en alguna de ellas siempre tienes la opción de cambiarlo por otro de más capacidad, aunque tendrás que pasar por caja, claro. Yo tengo una de 60 con backups, emus y más cosas y por el momento no tengo problemas.
P.D: El título del post es engañoso, da a entender otra cosa.