Sí, puede parecer engorroso pero necesitas conectar los dos transformadores de corriente, y la salida de vídeo la da la Megadrive (ideal por RGB). "Como máquina-addon" que es, depende por completo de la Mega.
Otra cosa, te hablo por mi experiencia con mi Megadrive I + MegaCD II:
Si quieres sacar el audio por otra vía que no sea el televisor, según que juegos, necesitarás conectar a la vez tanto las salidas RCA del MegaCD como el jack de auriculares de la Mega, porque muchas veces las melodías van grabadas en el CD y los efectos de sonido corren a cargo del chip de la Mega.
No sé cómo irá la cosa con la Mega II y el MegaCD I, alguien puede aportar info?
En cualquier caso, una vez montada, como amante de las máquinas clásicas, disfrutarla no tiene precio!