Aquí llega el endodoncista para solventar dudas.
El único pinchazo que vas a notar es el de la anestesia (como comprenderás, eliminar el nervio de un diente "en vivo" puede ser algo extremadamente doloroso) pero por lo demás no notarás nada.
Eso sí, son citas normalmente largas, o te lo hacen de una sola vez en 1h o 1h y 30m; o lo harán en dos sesiones (hablo solo de la endodoncia, no del empaste posterior).
Las "agujas" que mencionas, deben de ser las limas endodonticas, son 100% necesarias, piensa que las raíces son largas y que solo depositando un líquido no llegaría a limpiar el conducto de la raiz en su totalidad, de ahi que se necesiten meter las limas para limpiar como dios manda. Pero esas limas tu ni las vas a notar si te han dormido bien.
Y ni gas ni nada, como muchísimo te pondrá un spray tópico para que te haga placebo del pinchazo y poco más (sí, el spray es un placebo puro y duro, que te duerma la piel, no significa que los 3cm de aguja que penetra, el resto de recorrido este dormido también xD).
Así que ve sin miedo (aparte del que te podamos despertar los dentistas a modo general) que la endodoncia ya te digo, es más la pesadez e estar mucho tiempo con la boca abierta, que preocuparte por lo que te pueda doler.
P.D. No es una "operación" ni hay bisturí ni historias, el proceso es similar a un empaste salvo por el tema de las limas y el tiempo.