Es lo mismo una consola que la otra.
Lo que sucede es que la XL es más grande, y quizá por ahí sí hay gente que opine que para un crío pequeño es mejor la 3DS "original", que es más pequeña y acorde a las manos de un niño. No lo sé, lo digo porque es la única razón que se me puede ocurrir para argumentar que la XL "sea menos apta para un crío", como parece que te dijeron.
Eso sí, yo creo que la XL tiene pantallas más grandes, mejor autonomía, y estéticamente es más "slim", más bonita. Pero no trae cargador incluido y además es un poco más cara.