Tu le metes el archivo de actualizacion, le das a actualizar, y en teoria se actualiza sin borrarte nada, pues no se modifica para nada la memoria flash que contiene los juegos, sino alguna memoria especifica para lo que es el firmware
De todas formas siempre es recomendable hacerse un pequeño backup de las partidas por si las moscas, por ahi tengo yo un programa de backup (que no se de donde lo baje) especifico para g6 lite (aunque supongo que valdria para cualquier cartucho que guarde en *.0, *.1, *.2), que te hace las copias de las partidas automaticamente al disco duro (lo digo por el tema de no tener que ir seleccionando las partidas de entre todo lo q son los archivos de la carpeta NDS o GBA ^^U)
De todas formas, en tema de compatibilidad de juegos, lo principal es tener el programa de pc al dia, pues es el que parchea los juegos correctamente para que los soporte la tarjeta
Saludos ^^U
