No soy futurólogo, así qu eno se si se chapará el canal en el futuro o si se brickeará la consola. Te puedo recomendar que el día que haya una actualización te pases por los foros y mires si no hay peligro.
El "único" rastro que habrá es en el Diario de la consola. Los tickets, tmds y apps quedan borrados (lo que no se es si el WAD-Uninstaller borra los directorios donde han estado).
Espérate un poco, pork creo que no han liberado la versión final, la que hay publicada es a modo de ejemplo.
Sí, necesitas el Zelda al principio, para arrancar un boot.elf (mira el foro para más señas). Te recomiendo instalar el Homebrew Channel sin tiempo límite y luego desde ahí cargar algún loader renombrado a boot.elf, como el Mag Loader.
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