Para apagar a veces uso tal cual poweroff, que viene a ser como la version corta y facil de recordar de shutdown -h now , y solo uso shutdown -h +30 por ejemplo si el apagado lo quiero que lo haga pasado 30minutos. Los demás comandos ni idea y poco se usarán pienso yo.
apt-get y aptitude son programas diferentes para instalar desde repositorios, digamos que hacen lo mismo pero a su manera, personalmente nunca uso aptitude. dpkg se usa para instalar un paquete .deb que ya tienes bajado de algún sitio (aunque gdebi lo hace gráficamente simplemente abriendo el deb) y para arreglar alguna instalación a medias de algún paquete.
Personalmente en distros basadas en Debian (Ubuntu y otras tantas) instalo los paquetes o gráficamente por synaptic, o si son muchos paquetes y se los nombres uso apt-get install y todos los nombres de lo que quiero instalar.
Yo empezaría por instalar synaptic y gdebi.