Hola, fran_jrr
hace tiempo tuve que editar tambien unos videos .mod , tb eran de una camara jvc con disco duro...(supongo que usaran ese formato para no pagar por las patentes de algun otro formato vete a saber pero termina siendo un engorro para el usuario final)
la cosa es que mi opción fue cojer el virtualdub abrir los .mod y pasarlos a cualquier otro formato (divx o el que mas te guste) eso si actiba alguna opción de desentrelazado (no se ahora mismo como se llama el filtro) sino activas el filtro ese te saldran unas rallas muy majas en los videos al verlas en el pc (ya que las lineas pares e impares de la imagen iran desafasadas de algun frame)
espero haberte ayudado