Si usas After Effects no sólo para cuatro cortes y efectillos sencillos, sino para proyectos con tela, siento decirte que no hay un sustituto que ni se le acerque al After Effects.
Es una pena, simpre ando buscando por programas para sustituirlo, pero es imposible. Todos los que hay son más del estilo del Premiere. A ver si algún dia a los de Adobe se les va la olla y deciden portar dicho programa a Linux. Así mismo es imposible correrlo en Wine y salvo que tengas un maquinón es imposible virtualizarlo.
Es una de las pocas cosas que me atan a mantener una partición con XP...