Hola
Seguramente tu win98 tenga ya autoarranque, así que solo tendras que meterlo en la unidad y dejarlo arrancar solo.
Hay algunos portatiles (como el mio, un toshiba satellite 1800) que si quieres arrancar desde otra unidad que no sea HDD te dice que pulses una tecla (en mi caso F2), pero por lo demas es lo mismo.
Un saludo