Gracias a una pista que me dió Asashi, he conseguido flashear un 47D y un 46
EL truco para las placa base de Gigabyte es actualizar los drivers de la controladora SATA. Tenéis que ir a la web de Gygabyte y bajaros los drivers actualizados para vuestra placa. [URL=http://www.giga-byte.com/Support/Motherboard/Driver_List.aspx]
Hacer clic aqui para ir a la web [/URL]
En mi caso, venia con la version 5.10 y la más actualizada era la 6.85.
Bueno al lío, tras actualizar los drivers continuaba sin reconocer ambas unidades. Finalmente, tras pasar del canal SATA del cuatro puerto (en la placa base) al segundo, el Windows detectó a la perfección y pudimos ejecutar el flasheo de ambas unidades.
En el caso de la 47D nos dío un par de warnings pero apareció el esperado "DONE". La 46 entró sin warnings de ningún tipo. Todo OK.
En ambos casos utilizamos el Connectivity Kit de Xecuter, con la bandeja abierta. Probablemente al actualizar los drivers de windows también funcione correctamente el método del puente descrito en este y otros hilos.
Suerte con vuestro flasheo!