Yo te recomiendo mejor meter el emulador y las roms en el disco duro de la consola, asi te ahorras tener que ir grabando dvds pues si falla algo puedes arreglarlo, ademas no desgastas el lector.
Es posible que el fallo se deba a que no lo hayas grabado en formato UDF.
Ademas de que no es necesario crear antes una iso. Lo unico que hay que hacer es una vez tengas los archivos preparados, con el Nero seleccionas el formato de dvd UDF y activas una opcion de compatiblidad con Xbox, y pones a grabar los archivos si puede ser con la menor velocidad de grabacion posible.