Lo primero, comprueba que las temperaturas son las adecuadas durante esos cortes.
El ventilador, doy por supuesto que esta conectado a la placa, por lo que miraría en BIOS como tienes configurado la velocidad del mismo.
Si en esos cortes, la temperatura sube en exceso, deberías de cambiar el ventilador por otro, posiblemente este dándote un fallo por sobrecalentamiento.
Son comprobaciones básicas, pero importantes para que no se te fría el equipo.