Si, van sin ningun problema.
Para que los cargue automaticamente, los subtitulos y el archivo de video deben estar en el mismo directorio y tener el mismo nombre, por ejemplo "Pelicula.avi - Pelicula.ssa".
Tambien hay una opcion que te permite cargar el archivo de subtitulos que quieras mientras estas reproduciendo el video, sin que haga falta hacer lo de antes.
