Pufff... son bastante diferentes. De los dos que propones a mi el que más me gusta es el FF Tactics, pero como su nombre indica, es un "tactics" (pedazo de explicación la mía
).
Lo que quiero decir es que no esperes manejar libremente a tu personaje por el escenario, ni batallas en tiempo real o por turnos como las de cualquier otro FF. No se, mirate alguna review y te harás mejor idea, pero para mi es uno de los imprescindibles de GBA.
El Sword of Mana es de corte "clásico", pero... mmmm... dejemoslo en un "no esta mal" (ojo que a mi no me disgusta, pero los hay mejores)
Por tener tienes infinitas alternativas en esta consola, algunas maravillosas. Como recomendación de diría el Golden Sun (1 y 2), y el divertidísimo Mario & Luigi, sobre todo este último (te lo aseguro es buenísimo), aunque en los dos las batallas son por turnos y no en tiempo real como las del Minish.
Saludos!!