Hola , yo llevo ya mucho usando Linux/Debian y en la actualidad practicamente todos los emuladores los hacen multiplataforma , ya que utilizan en su gran mayoria las SDL.
Emuladores Multisistema que yo utilizo:
Mame -> Advancemame , xmame.
GB/GBC/GBA -> VisualBoyAdvance.
GameGear/Mastersystem -> Meka.
Nes -> FakeNes.
Snes -> Zsnes.
N64 -> Mupen64.
Psx -> ePsxe.
Psx2 -> Pcsx.
Megadriver ->Gens (creo recordar)
Aqui os pongo un enlace a una web de emus para Linux.
http://linuxemu.retrofaction.com/
Saludos.
