Lo del audio puede ser que tu teléfono no tenga la potencia suficiente o tenga un mal refresco de pantalla que no sea 60 hz. Si es eso poco puedes hacer, salvo usar un emu que te meta frameskip como aFBA. La configuración se debería de guardar sola sin hacer nada, pero yo siempre juego con mando, nunca de manera táctil, así que desconozco si los botones virtuales se pueden configurar de varias formas o no.