No me parece una pregunta estúpida y creo que le debéis una disculpa al que la formuló.
Tener que estar gestionando dos tarjetas flash y/o slots (por no nombrar el gasto que supone comprar otra tarjeta, aunque principalmente es por facilidad/comodidad) no te hace rentable tener un segundo slot que gestionar y/o bootear.
Quizás no hablemos de un emulador, sino de un homebrew o algo que boote desde el slot 2, pero en vez de cargar el cartucho que tengas introducido, que cargues una de tus copias de seguridad de gba previamente. No se si me explico, ni siquiera si es posible, pero buscando un poco (tampoco demasiado, he de reconocerlo) ni he leido nada parecido, ni nadie que lo haya planteado así.
Ahora sí, y espero no haber ofendido a nadie con mi comentario incial, ¿es posible? (Obviamente no quiero ir cargando mis juegos de gba si puedo tenerlo todo en una DS guardada en un bolsillo)
Un saludo y muchas gracias