¿¿Supongo que a la carpeta sin el "%" le habrás añadido la bios y las roms??
Yo el gpsp lo hago funcionar sin problemas con el devhook emulando el firm 1.5 Te aparecerán dos ejecutables uno con % y otro sin %. Ejecuta el que no tiene %
Y casualmente el advance wars me lo acabo de pasar (el primero de los dos que hay para gba) con el gpsp y no le he encontrado ningún fallo. Va perfecto a 333 mhz
MacForever