Depende, si el emulador es comercial, si que es ilegal distribuirlo. Por ejemplo el Bleem, o uno de Saturn que hay rulando por ahi (puede ser algo asi como Giri Giri?)
El de N64, si se habla del que pienso, se extrajo del disco extra del Wind Waker, que traia el Zelda Master Quest de N64, asi que es propiedad de Nintendo y no puede ser libremente distribuido.