El CFE es el custom firmware enable . Ahora va por la versión 3.60. Es como un custom firmware, te permite cargar copias de seguridad de PSP entre otras opciones. Mirate el hilo del subforo de firmware y modchips, q esta explicado alli.
Para hacer funcionar el emulador no necesitas el CFE, sólo el chickhen, que ya te permite cargar homebrew. No se si tu fallo será que intentas ejecutar el emulador desde una PSP con firm oficial...
Lo que tienes que hacer es poner en tu psp el firm oficial 5.03 (si tienes un firm superior, no podrás hacer nada, si lo tienes inferior, primero tendrás que actualizar a este firm), instalar el chickhen, lo ejecutas, después conectas tu PSP al pc, metes en la memory card en la ruta PSP\GAME la carpeta del emulador con unas cuentas roms (yo cogí el emulador de post "recopilatorio de emuladores" que está en este mismo subforo) y listo, a jugar.
Yo usé este tuto para el chickhen y el CFE... echale un vistazo, q es muy sencillo
http://www.elotrolado.net/hilo_tutorial-modificar-una-psp-3000-cfenabler-v3-60_1265134