yo use el tutorial de ps2reality y te explico:
metes el emulador en una carpeta
necesitas el bios de la neogeo eso es indispensable
creas una capeta que se llama cd
y ahi metes la iso descomprimida, al loro descomprimida, que a mi tambien me paso al principio.
cuando tengas esto lo quemas como te dice en el tutorial.
lo mejor es crear un emulador con un juego en la carpeta cd y quemarlo, tendras cada juego en un cd con su emulador y no tendras que cambiar el cd
un saludo