Yo creo que si lo metes por el slot de gba si que puedes jugar a juegos de gba. Si además sobresale un poco y tu tarjeta es miniSD, entonces seguro que puedes. (Te lo digo pq yo tuve ese modelo (M3 perfect MiniSD)
Al igual que haces con los juegos de NDS el loader te da la posibilidad de grabar los de GBA, el segundo botón pone GBA WRITE, pruébalo así.