En teoría sí se puede hacer eso. Pero solo en juegos que no requieran comprobación por parte de la plataforma o que no tengan una encriptación (aunque puedes desencriptarlo).
Por ejemplo, si juegas a un juego competitivo online, y modificas uno de los archivos, puede pasar que el juego no inicie, o que te baneen por hacerlo.
Si es un juego que no necesite de conectarse a internet, seguramente no tengas problemas en cambiar los archivos. Como mucho, te tirará algún error (por ejemplo si es archivo no es del mismo tipo, o si el peso de este es distinto).
