Hola.
También tenía esa duda e hice una prueba.
He creado una carpeta Juegos God en un disco duro externo y añadí la ruta en el FSD.
Dentro de esa carpeta he guardado juegos en formato GOD de XBOX 360 y de XBOX 1 cada uno en su directorio.
El FSD ya se encarga de mostrar en games los de Xbox 360 y en Xbox classic los de XBox 1.
Saludos.