Yo he votado por Shinobi, aunque con el corazón dividido.
En Master System, ambos juegos me gustan muchísimo, pero para mí, Shinobi siempre tuvo magia y Ninja Gaiden fué "sólo" un juegazo. Shinobi III es uno de los mejores juegos de 16 bits, mientras que en 128 bits, Ninja Gaiden gana de calle (aunque para mí, quizás esté un pelín sobrevalorado).
Muy ajustado, pero voto para Shinobi. La magia de la infancia puede con la objetividad.
Un saludo.