El problema es que primero el ecosistema alrededor de ese tipo de cajas es prácticamente nulo (mira la cantidad de fuentes que entran, o incluso la variedad de placas que sean mini-itx a secas y no sean variantes unos mm mas grandes.)
Casi mejor subir un poco más el espacio (en sub 10l hay más variedad) pero sigue siendo todo muy caro.
Y si, los componentes se calientan más que en una caja con mejor flujo de aire obviamente, pero con el throttle estarás a salvo aunque no es ideal.