Hola.
A mi me pasó algo parecido, y quizá te ocurra lo mismo que me ocurrió a mi.
Verás, en el tutorial de EOL no mencionan que el interruptor del programador debe estar en una posicion en concreto para que se pueda programar, a simple vista parece que se programa, lo detecta el flasheador, lo flashea con la nueva bios... pero no funciona no (yo tenia los dos interruptores en una misma posicion y parecia programarse, peeero no era así xD). Probé combinaciones con los interruptores (programandolo cada vez con cada combinacion) hasta que al final funcionó.
Un saludo.