Depende de qué medicamentos se traten.
Las típicas pastillas que no son en cápsula, sino que son en polvo (tipo aspirina, por ejemplo) problema no hay, porque en cuanto llegue al estómago eso se va a disolver. Pero ojo, que no todas las pastillas que son así siguen esa misma regla. Las que son tipo cápsula, normalmente es para que el cuerpo vaya absorbiéndolas poco a poco.
Como bien han dicho, en el prospecto suele indicarlo. Hay medicamentos donde dice que NO se machaque la pastilla, que se tome directamente, y que se intente mantener el menor tiempo posible en la boca (precisamente por eso).
También hay bastantes medicamentos (antibióticos y demás) que los hay tanto en pastillas como en sobres. A mí, por regla general, me suelen preguntar si prefiero sobres o pastillas, y en el caso de que me manden sobres directamente, pregunto si hay pastillas, porque yo soy al contrario, prefiero las pastillas.