A ver, es normal perder espacio no solo por el que ocupa el propio sistema. Tenéis que tener en cuenta que al formatear un disco duro sea en el sistema que sea hay un espacio reservado para el indice del sistema de archivos que a mayor capacidad del disco, mayor tamaño tendrá el índice. Por eso cuando hacemos un formateo rápido es posible recuperar la información, por que solo borra el índice (el formato), los datos siguen estando físicamente en el disco hasta que se escribe encima de ellos.