Si el lector está roto, normalmente laser fundido, lente quemada, no hay problema, lo dejas y listo, como no lee, como si no hubiera CD/DVD, no da problema.
En el caso de que saques la maquinaria del lector (en la Slim para poner un HDD en su lugar) entonces lo que has de evitar es "acceder" al lector, sino se cuelga la play, ya que no le informa de que no hay un CD/DVD, sino que hay un error de hardware.
En todos los casos puedes usar el OPL, Ulauchelf, dado que en los dos casos el acceso al lector es a petición del usuario.
En el caso de algún emulador hace una busqueda en el lector, por ejemplo el SNES necesita tener la bandeja cerrada sino no arranca, y puede que alguno más.