¿Pero si quiere tener los dos escritorios para qué va a recompilar sin soporte para KDE? Igual lo he entendido mal, pero creo que se refería a poder utilizar los dos indistintamente... sin borrar KDE, ¿no?
Si es así, sólo con instalar gnome (activando USE="gtk2 gnome" si no lo tuvieras ya) sería suficiente. Y bueno, si ahora utilizas kdm y quisieras utilizar gdm... editar /etc/rc.conf
¡Saludos!