La unica diferencia esta en la perfeccion de las "marcas" que se hacen en el surco.
Si el disco gira a mas velocidad, en vez de quemar "marcas" cirulares perfectas se formaran marcas cada vez mas achatadas cuanto mayor sea la velociad de rotacion y menor sea la calidad del soporte y del laser (tambien puede influir la refexion e includo el firm de la grabadora, aunque en menor medida).
Esto en realidad no deberia dar ningun problema a la hora de leerlo, salvo que topes con algun lector muy tiquismiquis o antiguo que no identifique correctamente las marcas cuando estan muy achatadas.
Si no tienes prisa mi recomendacion es siempre grabar a la menor velocidad que puedas sobre todo en DVD y CD en modo 2.
Bueno, de forma secilla esta es la explicación, si estas interesado en mas detalles hay extensa documentación sobre el asunto que te podria facilitar.
Saludos