Gracias por la respuesta naeru, pero creo que no me he explicado bien.
El software que usamos es un programa que utiliza directamente el escaner:
Recibimos documento junto mercancia -> desde el programa escaneamos documento -> el programa guarda la imagen, en una base de datos de formato propietario y le informamos el resto de campos (fecha de entrada, nº serie...) -> cuando sale esa mercancia se imprime desde el programa un formulario con la imágen y los campos informados.
Ahora en lugar de un documento, recibimos un pdf por mail
Por eso no nos sirve de nada un programa para escanera documentos a ficheros de imágenes, si no que necesitamos algo que cuando nuestro soft "busque" un escaner, nos pregunte que fichero queremos "escanear" y este se lo pase al programa como si de un escaner se tratase...
Saludos