No tiene importancia si es sólo por unos días.
Para empadronarte necesitarás un documento firmado por tu madre en el que os autoriza a ambos a volver a empadronaros.
Algo así:
"Dª Nombre Apellido Apellido, con DNI núm....., propietaria y vecina del inmueble situado en la C/...., con referencia catastral....AUTORIZO a D......con DNI núm... y Dª............. con DNI núm.... para que se empadronen en el mismo.
Fdo. Dª Nombre Apellido Apellido"
Consulta la web de tu ayuntamiento porque seguramente ya te dan en la web un modelo de autorización de empadronamiento; y si no es así, acércate a la oficina del Padrón y pídeles un impreso de autorización de empadronamiento.
Salu2