Mira, a mi me pasaba lo mismo... Lo solucione con dos cosas que hice a la vez, asi que no se que fue de las dos, pero empezo a glitchear...
1º) Estaba usando el J-Runner... y cambie por el Xell de blackat con el AutoGG.
2º) El cable del postfix mucho mas largo... lo puse con el largo justo y nada... le hice dos "rulos" bastante grandes entre el southbridge y el cristal de abajo.
3º) un capacitor de 470pF en el cable del postfix.
Igual esto depende de la placa de glitcheo que pongas... yo ahora estoy usando un matrix glitcher v3 (con chip pequeño) que son de lo mejor... no fallan nunca y arrancan entre uno y cinco parpadeos en cualquier consola...