Hombre es la de siempre, de que una aplicación te tarde en arrancar 1 a 2 segundos en un superordenador de última generacion no se nota mucho, pero que tarde 15 a que tarde 25 pues si.
Yo lo uso, y problemas no me ha dado, aunque tampoco he notado gran diferencia. Pruebalo, haz el emerge y ejecuta el comando. Si no va mejor no pierdes nada, ademas se puede deshacer el prelinkado.
Realmente es necesario poner -fPIC en las CFLAGS?? Segun tengo entendido no, solo es necesario en ciertas librerias, y deberia venir ya en los .ebuild necesarios.
Saludos.