Te sugiero que cambies de region con la consola apagada, ya que es un cambio de corriente entre pines, con lo que hacerlo en caliente, puede suponer este problema.
En segundo caso, pon una conbinacion, en el menu de la consola, entra en ajustes y abajo a la derecha, pone la region. Despues apaga y cambia la combinacion, y repite el proceso, asi identificas si cambia de region.
P.d. Hay mods, que aunque pone ntsc, solo cargan pal (si la consola es pal) y solo cambian con el selector de hz (como la snes).