Para extraer IOS en formato WAD de los juegos existe el WUFE
Para los Wads (supongo que te refieres a los canales) usa el FS Dumper de Waninkoko o el YaWnD de Redbird. Despues tendras que empaquetar tu solo los wads, ya que te salen desempaquetados
Para los savegames existe el Savegame Esxtractor, de Waninkoko, aunque ahora tambien puedes extraer los savegames que antes no se podian (SSBB, RRR2...) con el rebooter del GeckoOS o del BackupLauncher 0.3Gamma