Si, en la anterior version podias elegir el destino pero eso servía de poco ya que si intentas instalar en la SD algo que va en la NANDA directamente da error por destino inválido y si se instala en la NAND algo que va en la SD lo que ocurre es que aparece un icono negro en el menu que no funciona.
Imagino que lo que hará ahora la nueva version es instalar automáticamente en la NAND o la SD en funcion de lo que se esté instalando, de esa forma no hay problema de instalar algo donde no se debe. Vamos, lo que siempre ha hecho DevMenu y BigBlueMenu