1º Copia el programa, e instala el driver del puerto usb.
2º Si el cartucho es de 64M puedes meter 2 juegos de 32M siempre que no ocupen los 32M justos, tendrías que reducir el espacio sobrante o bien a mano, o usando un programa que se llama "Remove the non required space" (usa la busqueda avanzada para encontrarlo). En algunos casos al elegir el juego, el writer te pone # al final del nombre, si es así ya no tienes que reducir el espacio, te lo hace el programa directamente.
Para mas ayuda, el programa te indica en que cartuchos puedes flashear a medida que vas colocando las roms a flashear.