Bueno, yo no tengo chip casero, y no sé si este método funcionará para éste, pero allá va.
Para flashear las bios sólo hay que poner en el directorio C:\bios\ la imagen binaria (archivo .bin o similar). Dentro de los menús de Evox hay una opción "Flash Bios" (en mi caso se llega a través de Settings->Flash Bios). En teoría debería flashear las bios de vuestro chip (nunca lo he hecho de esta manera).
Una cosa más: haced un par de retoques en evox.ini, en las últimas lineas poned un '#' delante de las líneas "format c:" "format e:" etc. No estoy seguro pero si no lo haceis podría formatear todas vuestras unidades en el proceso.